Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4285406	4285420	15	14 [0]	[0] 30	yjcF	conserved hypothetical protein

GCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTT  >  W3110S.gb/4285421‑4285485 |                                                                 gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTTGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:1690733/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:2147511/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:996109/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:948360/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:874779/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:693543/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:554327/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:542084/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:536513/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:444351/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:430499/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:389644/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:2460487/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:2436976/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:2329323/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:2180660/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:1017619/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:190000/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:1736048/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:1512751/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:1290931/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:1280251/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:1277443/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:1261645/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:1246152/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:1244290/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:113860/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:1109479/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:1092033/65‑1 (MQ=255) gCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAAttt  <  1:1051852/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GCATGAAGATTATCCTCAGTTTGTGACATGCCAGTATGAGTGGCACAATCTTCTTCAAAGAATTT  >  W3110S.gb/4285421‑4285485

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑