Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4337061	4337086	26	23 [0]	[0] 24	basS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with BasR

ACTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTG  >  W3110S.gb/4337087‑4337149 |                                                               aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:1782000/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:948304/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:90977/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:542014/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:31056/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:302499/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:257445/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:2471991/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:2419844/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:2223938/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:2149247/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:2145543/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:1164274/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:1774718/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:1766443/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:1761424/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:1737868/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:1588951/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:1571307/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:1553276/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:1371782/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:1284018/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:1236407/63‑1 (MQ=255) aCTGCCATGACCGCTCCGTCATCTCCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTg  <  1:1716617/63‑1 (MQ=255) |                                                               ACTGCCATGACCGCTCCGTCATCTTCTTGCAGCTTAATCATAATGTTGCTGCCTTGCGGGCTG  >  W3110S.gb/4337087‑4337149

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑