Missing coverage evidence...
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CTCTTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGTTG  >  W3110S.gb/4438837‑4438902 |                                                                  ctctTTGCTGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:2238335/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAg                  >  1:2056893/1‑50 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:2512519/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:2030342/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:2049236/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:2199343/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:223825/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:2246350/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:2328700/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1975215/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:297852/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:336292/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:494249/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:614623/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:620520/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:703446/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:886019/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1439287/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1108757/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:112516/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1241112/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:137631/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1381480/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1386270/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1398002/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:140874/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1050129/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1533556/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1562099/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1599335/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1701570/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1821677/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1865759/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGtt   >  1:1910018/1‑65 (MQ=255) ctctTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTT‑GGGGGTGTTg  >  1:2154658/1‑65 (MQ=255) |                                                                  CTCTTTGCGGAACAGTGCCCGTCGCGCGAGGTGTTGAAACACGTCACCAGCCGTTGGGGGGTGTTG  >  W3110S.gb/4438837‑4438902

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑