Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4501763	4501806	44	15 [0]	[0] 34	intB	predicted integrase

GCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCCATCAT  >  W3110S.gb/4501807‑4501871 |                                                                 gCCGTAGAAATGTCTGTACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:1422662/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:2090944/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:2064664/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:2148217/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:2200633/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:2241758/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:2319238/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:2319621/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:268164/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:391078/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:491489/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:71434/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:745118/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:764790/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:784367/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:832935/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:862508/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:905846/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:1097308/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:2055683/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:1980270/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:1870848/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:178941/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:1762033/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:1707284/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:167808/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:1409128/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:1376130/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:1375004/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:1280623/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:1246279/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:1231362/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:1217006/65‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCcatcat  <  1:1177866/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GCCGTAGAAATGTCTGGACGTCTTGAAGTGGCCGCTCGTCTTCAGCAGCGCACTACAGCCATCAT  >  W3110S.gb/4501807‑4501871

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑