Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4546447	4546483	37	9 [0]	[0] 14	fimB/fimE	tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA

TTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAT  >  W3110S.gb/4546484‑4546547 |                                                                ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAt  <  1:1384131/64‑1 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAt  <  1:1473852/64‑1 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAt  <  1:1476798/64‑1 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAt  <  1:1490664/64‑1 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAt  <  1:1537383/64‑1 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAt  <  1:1787742/64‑1 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAt  <  1:1955496/64‑1 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAt  <  1:2278036/64‑1 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAt  <  1:359715/64‑1 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAt  <  1:475638/64‑1 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAt  <  1:540281/64‑1 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAt  <  1:562848/64‑1 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAt  <  1:661909/64‑1 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAt  <  1:874350/64‑1 (MQ=255) |                                                                TTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAAT  >  W3110S.gb/4546484‑4546547

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑