Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	348955	349106–349058	104–152	5 [0]	[0] 30	prpB/prpC	2‑methylisocitrate lyase/2‑methylcitrate synthase

TGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATAA  >  W3110S.gb/349107‑349171 |                                                                 tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1839268/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:864831/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:759350/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:642181/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:592577/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:480895/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:379191/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:294859/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:2443732/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:2170210/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:2109060/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:2106800/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1910251/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1906693/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1874260/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1041794/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:181867/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1794511/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1760628/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1756697/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1738693/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:165973/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1640302/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:159029/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1511400/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1486190/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1384918/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1237307/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:1234944/65‑1 (MQ=35) tGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATaa  <  1:122182/65‑1 (MQ=35) |                                                                 TGCCTGATGCGCCGCTGACGCGACTTATCAGGCCTACGGGGTGAACTGAACTGTAGGTCGGATAA  >  W3110S.gb/349107‑349171

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑