Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	354896	354898	3	5 [0]	[0] 39	codB	cytosine transporter

ATGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTGGG  >  W3110S.gb/354899‑354963 |                                                                 aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGTTTGTGGTGCTggg  <  1:1713395/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:280093/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:1045972/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:291681/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:310778/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:344106/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:382635/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:493819/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:534132/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:539776/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:624570/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:625827/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:630265/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:658327/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:709912/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:785593/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:864346/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:87629/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:959934/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:2378634/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:1027344/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:1049871/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:1087962/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:1332391/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:1409693/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:1523675/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:1645629/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:1655342/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:1736499/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:1773684/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:1844740/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:185632/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:1935771/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:2017115/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:2098799/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:219427/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:249371/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCAGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:330764/65‑1 (MQ=255) aTGGCGGATATCTCTGATCTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTggg  <  1:979134/65‑1 (MQ=255) |                                                                 ATGGCGGATATCTCTGATGTGATGATTGCTCAGGGCCTGCTGCTGCCTGCGATTGTGGTGCTGGG  >  W3110S.gb/354899‑354963

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑