Missing coverage evidence...
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TTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGA  >  W3110S.gb/360529‑360594 |                                                                  ttATTTCGCGAATAACCCGACATGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:1345635/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTTGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:663139/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:460288/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:2341411/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:2375446/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:2388172/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:2415012/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:2541941/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:266367/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:313640/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:449157/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:2062240/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:555533/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:561898/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:671541/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:868940/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:932162/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:974728/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:162125/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:1016518/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:1123412/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:1167692/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:1194885/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:1270394/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:1522504/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:1528391/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:2263912/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:1644310/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:1693650/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:1799930/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:1960215/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:1975362/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:2023001/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTtgtg   <  1:1002095/65‑1 (MQ=255) ttATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGT‑‑AATGTCTTTTGTGa  <  1:1282075/64‑1 (MQ=255) |                                                                  TTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGA  >  W3110S.gb/360529‑360594

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑