Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	401713	401747	35	16 [0]	[0] 34	phoA	alkaline phosphatase

AGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGTT  >  W3110S.gb/401748‑401812 |                                                                 aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTg             >  1:429439/1‑54 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGGTTGGCCTGt   >  1:1442362/1‑64 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:2384701/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:1763238/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:1949868/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:2126555/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:212940/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:2236782/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:2283089/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:2374138/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:1759261/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:2434209/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:2449667/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:2512296/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:472266/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:707126/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:764452/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:1387489/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:1010766/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:107914/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:1107608/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:111526/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:1278076/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:135429/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:1358312/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:1010473/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:1429451/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:156170/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:159064/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:1594082/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGtt  >  1:1662760/1‑65 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGt   >  1:2357276/1‑64 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGt   >  1:1489600/1‑64 (MQ=255) aGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGt   >  1:1215098/1‑64 (MQ=255) |                                                                 AGCGATGCTGCCTCACTGAATTCGGTGACGGAAGCGAATCAGCAAAAACCCCTGCTTGGCCTGTT  >  W3110S.gb/401748‑401812

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑