Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	488311	488319	9	30 [0]	[0] 33	kefA	fused mechanosensitive channel proteins

TGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAC  >  W3110S.gb/488320‑488382 |                                                               tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTTCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:8563/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:2272061/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:911141/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:883846/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:816440/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:744871/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:741218/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:658716/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:560181/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:550167/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:466788/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:423124/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:420269/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:397218/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:328229/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:2487802/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:1794206/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:1245490/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:1367471/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:1392073/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:1474684/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:1599056/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:1648326/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:1657938/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:1694659/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:181080/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:1813526/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:1880037/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:1955381/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:2028391/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:226513/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCAGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:2378001/63‑1 (MQ=255) tggtggCCTGGGCGGTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAc  <  1:1081298/63‑1 (MQ=255) |                                                               TGGTGGCCTGGGCGTTGATTCGCAACCTGCCTGGTTTACTGGAAGTGCTGGTGCTCTCGCGAC  >  W3110S.gb/488320‑488382

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑