Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	538999	539030	32	15 [0]	[0] 40	allB	allantoinase

GTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCA  >  W3110S.gb/539031‑539095 |                                                                 gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:495192/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:2340322/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:2441967/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:2500660/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:374229/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:394255/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:412052/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:434081/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:439984/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:446200/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:2281680/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:623476/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:691876/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:693631/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:715394/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:786465/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:790205/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:808904/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:917631/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:957498/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:1623701/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:1069616/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:1132954/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:1166883/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:1247040/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:1362545/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:1408386/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:1508510/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:1547807/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:1613246/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:103936/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:1708658/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:1892932/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:1905199/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:192862/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:2000946/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:2025733/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:2038280/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:2048927/65‑1 (MQ=255) gTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCa  <  1:2085056/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GTGGAAGCAATTCGCCGCGTACTGTATCTGGCGAAAGTTGCTGGTTGCCGTCTGCACGTTTGCCA  >  W3110S.gb/539031‑539095

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑