Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	539342	539355	14	14 [0]	[0] 40	allB	allantoinase

TGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCGG  >  W3110S.gb/539356‑539418 |                                                               tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGc                           >  1:1465896/1‑38 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATTGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1465746/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:473986/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:2297595/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:2313880/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:2330327/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:2489250/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:282101/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:317312/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:330050/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:343958/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:388803/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:459188/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:2201435/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:481/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:496339/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:594065/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:665911/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:679815/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:682396/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:818387/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1849697/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1237728/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1305030/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1328705/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1361106/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1376520/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1528360/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1595059/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1676713/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1775160/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:2223773/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1898509/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1948917/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1991699/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:2041533/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:2076638/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:2084232/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:2132520/1‑63 (MQ=255) tGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCgg  >  1:1195256/1‑63 (MQ=255) |                                                               TGAAAGCATGGGGCGGTATCGCCGGTCTGCAAAGCTGCATGGACGTGATGTTCGATGAAGCGG  >  W3110S.gb/539356‑539418

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑