Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	559443	559464	22	4 [0]	[3] 36	sfmD	predicted outer membrane export usher protein

CCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAG  >  W3110S.gb/559451‑559527               |                                                               ccTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTaa                                            >  1:1077204/1‑35 (MQ=255) ccTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTaa                                            >  1:1136259/1‑35 (MQ=255) ccTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTaa                                            >  1:442314/1‑35 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:79484/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:2376128/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:265243/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:376355/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:536630/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:630491/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:649296/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:738291/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:753489/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:224704/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:862464/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:884032/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:904489/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:90582/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:954650/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:991191/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:176609/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:1069224/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:1197132/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:1287749/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:1526880/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:157731/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:1628914/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:1752921/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:1763578/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:2279561/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:198370/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:2016233/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:2033538/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:2136836/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:2236648/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:1042784/63‑1 (MQ=255)               gAATTATAATTTCACCGGTAAAAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAg  <  1:2132076/63‑1 (MQ=255)               |                                                               CCTGCTTTACTCCTGAATTATAATTTCACCGGTAACAGAGGTAATGGTAACGATAGCTATTTTTTTAGTGAGCTCAG  >  W3110S.gb/559451‑559527

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑