Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	559696	559771	76	11 [0]	[0] 25	sfmD	predicted outer membrane export usher protein

TTTGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGTTT  >  W3110S.gb/559772‑559836 |                                                                 tttGCCGCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:405083/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACTGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:776138/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:234662/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:911927/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:905914/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:683919/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:599093/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:545510/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:538674/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:404998/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:369526/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:369243/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:310506/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:1089365/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:2111419/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:2102447/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:2063454/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:2057077/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:2025235/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:1792938/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:1731904/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:1524741/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:1458092/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:1418771/65‑1 (MQ=255) tttGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGttt  <  1:1370995/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TTTGCCCCAACGGTACGTGGGATTGCCCGTACGGCGGCCCAGCTAACGATTCGGCAAAATGGTTT  >  W3110S.gb/559772‑559836

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑