Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1015345	1015404	60	27 [0]	[0] 40	ymbA	conserved hypothetical protein

GTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGT  >  W3110S.gb/1015405‑1015469 |                                                                 gtggtgCAGCGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGt                      >  1:1449418/1‑45 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAATGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:2510801/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAgg   >  1:71369/1‑64 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAg    >  1:2422881/1‑63 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1953595/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1874353/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:2332502/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:257659/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:274017/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:324413/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:432777/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:441786/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:739809/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:758604/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:764371/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:815292/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:833655/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:849233/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:878551/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:916749/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1642536/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1171279/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1185343/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1223972/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1457350/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1555259/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1560336/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1617499/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1639564/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1000934/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1668902/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1691197/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1694032/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1712705/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1788756/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1797159/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1834598/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGt  >  1:1843731/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGATATGGGTAGAGCAGGt  >  1:784924/1‑65 (MQ=255) gtggtgCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATAGTCTGTTATGGGTAGAGCAgg   >  1:1832218/1‑64 (MQ=255) |                                                                 GTGGTGCAGAGCGGTACACAAAGTACCGCCAGCCAGGGCAATCGTCTGTTATGGGTAGAGCAGGT  >  W3110S.gb/1015405‑1015469

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑