Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1039321	1039333	13	12 [0]	[0] 34	appC	cytochrome bd‑II oxidase, subunit I

CATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGC  >  W3110S.gb/1039334‑1039398 |                                                                 catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACTCTGc  >  1:738493/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTg   >  1:1644402/1‑64 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:2360525/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:2161145/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:2164290/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:2203224/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:2278262/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:2300631/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:232580/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:2328488/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:2115104/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:23788/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:296333/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:378019/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:379178/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:477314/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:559810/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:932895/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:1014978/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:210251/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:2066970/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:1824570/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:1797210/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:1764175/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:1663659/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:145974/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:1377577/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:1229950/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:1188505/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:1145841/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:112256/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:1106311/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:1067865/1‑65 (MQ=255) catcatGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGc  >  1:1058375/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CATCATGGTGGGCTGTGGTTCCCTGCTGCTACTGGTGATGCTGATTGCGCTTGTCCAGACGCTGC  >  W3110S.gb/1039334‑1039398

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑