Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1057386	1057387	2	38 [0]	[0] 29	torT	periplasmic sensory protein associated with the TorRS two‑component regulatory system

GCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCT  >  W3110S.gb/1057388‑1057452 |                                                                 gCAGAGGCGGCAATGGGGTAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:493947/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGTAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:342939/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACTCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:1465105/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTTCCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:942247/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:2210787/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:872146/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:835793/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:651443/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:627067/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:543010/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:5136/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:449268/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:442224/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:2297425/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:2215616/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:1023600/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:2142154/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:2008886/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:1982450/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:1688807/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:1672976/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:1544300/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:1450016/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:1403674/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:1375008/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:1239780/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:1133083/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:112755/65‑1 (MQ=255) gCAGAGGAGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCt  <  1:319714/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GCAGAGGCGGCAATGGGGGAAGGGCGTAACCTGAAAACGCCGCTTACCGTGGTGTCGTTTTATCT  >  W3110S.gb/1057388‑1057452

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑