Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1059299	1059428	130	25 [0]	[0] 41	torC	trimethylamine N‑oxide (TMAO) reductase I, cytochrome c‑type subunit

CGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTA  >  W3110S.gb/1059429‑1059493 |                                                                 cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGGGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:68554/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGAtt                       >  1:19165/1‑44 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTAc               >  1:2162003/1‑52 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACgg          >  1:1374755/1‑57 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGt   >  1:2231217/1‑64 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGt   >  1:2258652/1‑64 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGt   >  1:2078780/1‑64 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:369056/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:2248040/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:2309687/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:2503599/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:2525477/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:328677/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:345732/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:1121764/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:37243/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:436485/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:511889/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:548997/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:6442/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:66540/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:897582/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:930506/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:2213768/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:1024697/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:1287601/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:1562455/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:1605876/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:1619511/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:1685467/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:1711435/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:1793998/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:1864253/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:1890935/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:1973957/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:2042930/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:2118559/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:2198206/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:2226195/1‑65 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGAGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGt   >  1:2180453/1‑64 (MQ=255) cGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGAGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTa  >  1:942463/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CGACATGGTGAACGATATCAAACCGATCTGGGCTTATGCGGATTCGTTGTACAACGGCACCTGTA  >  W3110S.gb/1059429‑1059493

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑