Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1086054	1086071	18	6 [0]	[0] 32	phoH	conserved hypothetical protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain

CAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTCC  >  W3110S.gb/1086072‑1086136 |                                                                 cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTac                                >  1:2507514/1‑35 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:195028/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:949880/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:731976/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:673220/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:661554/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:635802/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:571039/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:551292/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:2493967/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:2432621/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:2357634/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:2278878/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:2213434/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:2011561/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1139328/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1947125/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1863493/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1852469/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1650968/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1596075/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1558081/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1527/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1504626/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1474287/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1445476/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1437213/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1393938/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1277555/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1158380/1‑65 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTc   >  1:521094/1‑64 (MQ=255) cAGAAAAGTTTGCTACCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTcc  >  1:1476774/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CAGAAAAGTTTGCTCCCTATTTTCGCCCGGTCTACGACGTGCTGGTCCGGCGCTTAGGGGCTTCC  >  W3110S.gb/1086072‑1086136

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑