Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1110900	1110916	17	14 [0]	[0] 34	[mdoG]	[mdoG]

GAAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTC  >  W3110S.gb/1110917‑1110980 |                                                                gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:498185/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:2303800/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:2343531/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:2346526/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:2416306/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:350218/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:3815/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:422089/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:477218/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:2227832/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:561572/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:771940/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:836491/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:861113/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:867706/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:899885/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:995264/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:159378/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:1023620/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:111594/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:1266400/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:1362812/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:140901/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:1483117/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:1588578/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:1593274/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:1013540/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:1750591/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:1803477/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:1882960/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:1935454/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:1954259/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:2139900/64‑1 (MQ=255) gaAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTc  <  1:2221685/64‑1 (MQ=255) |                                                                GAAAATGCGTTGGTTGAGTGCTGCAGTAATGTTAACCCTGTATACATCTTCAAGCTGGGCTTTC  >  W3110S.gb/1110917‑1110980

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑