Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1131790	1131899	110	20 [0]	[0] 21	flgA	assembly protein for flagellar basal‑body periplasmic P ring

CGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAT  >  W3110S.gb/1131900‑1131964 |                                                                 cGTTGGCGCTAAACCCATCACTGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:2505230/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCTCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCtt             >  1:2085860/1‑54 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:2334716/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:905529/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:88506/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:863206/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:706367/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:481364/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:396574/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:317741/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:2345473/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:2345189/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:108674/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:1712133/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:1694996/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:1692850/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:1522571/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:1258512/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:1220615/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAt  >  1:1168018/1‑65 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCAGCCAt  >  1:1744695/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCAT  >  W3110S.gb/1131900‑1131964

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑