Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1142611	1142651	41	7 [0]	[0] 29	flgL/rne	flagellar hook‑filament junction protein/fused ribonucleaseE endoribonuclease and scaffold for formation of degradosome

ATTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATAAAAA  >  W3110S.gb/1142652‑1142716 |                                                                 aTTGTTGGTTGGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCa                 >  1:406226/1‑50 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaaa  >  1:1999746/1‑65 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaaa  >  1:331797/1‑65 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaaa  >  1:3403/1‑65 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaaa  >  1:2092098/1‑65 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaaa  >  1:2044762/1‑65 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaaa  >  1:1297474/1‑65 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:634786/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:632348/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:2481880/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:572295/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:80074/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:571396/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:808466/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:507836/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:85985/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:920187/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:288420/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:2488784/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:1132461/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:2367579/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:207158/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:2001116/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:1946588/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:1922641/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:1860385/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:1366851/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:1341142/64‑1 (MQ=255) aTTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATaaaa   <  1:1214553/64‑1 (MQ=255) |                                                                 ATTGTTGGTTAGCAAGGATGCCATTCGATGAATTTTAATATGTTGATTCAAAGATGAAATAAAAA  >  W3110S.gb/1142652‑1142716

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑