Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1178817	1178919	103	12 [0]	[0] 30	[lolD]–[lolE]	[lolD],[lolE]

AATTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTATTT  >  W3110S.gb/1178920‑1178984 |                                                                 aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:2327787/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:746355/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:636929/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:627070/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:517863/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:3438/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:304769/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:280211/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:261124/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:2538097/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:2428531/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:2393558/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:2384289/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:2349699/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:1265099/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:2297555/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:2194616/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:2171110/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:1963223/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:1875647/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:1823586/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:1803139/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:1652440/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:1639766/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:1615792/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:149569/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:1467108/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:1399743/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTAttt  <  1:128232/65‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGGCGCTGATCTCCGTTGttt  <  1:315970/65‑1 (MQ=255) |                                                                 AATTGGCCTGCGTTTTAGTCGCGGACGGCGGCGCGGCGGCATGGTGTCGCTGATCTCCGTTATTT  >  W3110S.gb/1178920‑1178984

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑