Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1202135	1202155	21	7 [0]	[0] 16	intE	predicted integrase

GGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTGG  >  W3110S.gb/1202156‑1202220 |                                                                 ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:1373850/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:1501583/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:1541291/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:1604492/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:1604934/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:2118662/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:2354514/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:2461379/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:2485841/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:2533703/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:258580/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:316693/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:408063/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:486386/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGACAGGCGAGTGTTgg  <  1:216528/65‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGGTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTgg  <  1:1698423/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GGTTGCGATCCTGTCACTGATAGCCAGAATCTGCCGGGTTCTTTGTTCAGCCAGGCGAGTGTTGG  >  W3110S.gb/1202156‑1202220

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑