Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1245719	1245897	179	31 [1]	[0] 35	ycgR	protein involved in flagellar function

CTGTGCCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCG  >  W3110S.gb/1245898‑1245962 |                                                                 ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:536702/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:283518/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:294094/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:311410/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:314583/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:40077/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:462400/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:508489/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:518733/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:262522/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:537248/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:673954/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:727912/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:811915/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:849090/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:91576/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:916325/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:993871/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:1738118/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:1335889/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:1482820/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:1515620/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:1539966/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:1600824/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:1661110/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:1686555/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:1699048/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:1188968/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:1921334/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:2140911/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:2351150/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:2407223/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:2408096/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:249328/65‑1 (MQ=255) ctgtgcCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCg  <  1:2514978/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CTGTGCCTTTAGCACGGCGATGTTGTCTTCGGCTTGACTGCCGAAATCCAGCACCAGTTTATCCG  >  W3110S.gb/1245898‑1245962

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑