Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1291004	1291028	25	5 [1]	[0] 21	rssA	conserved hypothetical protein

GTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTTCAA  >  W3110S.gb/1291029‑1291093 |                                                                 gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGTGCGTGTCTtcaa  <  1:871367/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:2309704/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:578763/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:2538755/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:2511559/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:2497398/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:247049/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:2467499/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:232282/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:2235430/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:212813/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:1928603/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:1575062/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:1553261/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:1463285/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:1456200/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:1228423/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:1153571/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGAAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:2401372/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGATCTATCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:967417/65‑1 (MQ=255) gTTTTACGCCTGATGGAGCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa  <  1:1171134/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTTCAA  >  W3110S.gb/1291029‑1291093

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑