Missing coverage evidence...
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GACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCC  >  W3110S.gb/1303865‑1303929 |                                                                 gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCTCCTATGGTTACACTcc  <  1:1762121/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:526751/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:2250563/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:2283770/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:2368632/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:240814/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:2534179/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:33330/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:397401/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:427351/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:432969/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:435035/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:2178638/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:550228/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:667818/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:669850/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:674588/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:785093/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:795583/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:854695/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:888128/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:901625/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:931645/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:1542442/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:1077416/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:1087555/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:1177185/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:1208591/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:1259941/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:1261595/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:1274604/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:1430107/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:1431522/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:1054601/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:1582716/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:1595577/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:164758/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:175748/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:1853028/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:2006816/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:201502/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:2058778/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:2132909/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:2161718/65‑1 (MQ=255) gACCGCGATATCATTGCTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTcc  <  1:816183/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GACCGCGATATCATTGTTAATAAAGTGAAAGCGCAGGGCAACATGCCCGCCTATGGTTACACTCC  >  W3110S.gb/1303865‑1303929

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑