Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1339690	1339787	98	6 [0]	[2] 42	acnA	aconitate hydratase 1

ATGACGCGGCATTTACCTGACAGCGACGTAGTCTCTATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCGG  >  W3110S.gb/1339756‑1339850                                 |                                                               aTGACGCGGCATTTACCTGACAGCGACGTAGTCTCTATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGc                                 >  1:2166832/1‑64 (MQ=255) aTGACGCGGCATTTACCTGACAGCGACGTAGTCTCTATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGc                                 >  1:2208375/1‑64 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAAcgccgc                  >  1:1181181/1‑47 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTg                >  1:2266766/1‑49 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:431140/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:2121752/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:2342324/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:2417453/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:404709/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:426514/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:429077/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1114635/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:614704/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:705721/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:761173/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:824486/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:836034/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:890871/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:919333/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1641316/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1089628/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1137677/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1234925/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1287013/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1312606/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1408176/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1509413/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:2041228/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1643222/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1780501/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1801109/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1888774/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1890539/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:1939223/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCgg  >  1:2034507/1‑63 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCg   >  1:2464907/1‑62 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCg   >  1:6980/1‑62 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCg   >  1:1303955/1‑62 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCg   >  1:1277140/1‑62 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCg   >  1:2146519/1‑62 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCg   >  1:915877/1‑62 (MQ=255)                                 ctctATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGCGATTGCCgg  >  1:2500897/1‑63 (MQ=255)                                 |                                                               ATGACGCGGCATTTACCTGACAGCGACGTAGTCTCTATTTATGATGCTGCGATGCGCTATAAGCAGGAGCAAACGCCGCTGGCGGTGATTGCCGG  >  W3110S.gb/1339756‑1339850

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑