Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1343286	1343296	11	16 [0]	[0] 33	yciM	conserved hypothetical protein

TGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAC  >  W3110S.gb/1343297‑1343359 |                                                               tGACATTGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:540063/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1954979/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1906913/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:2051836/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:2103798/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:2287753/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:2337963/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:2466532/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:452215/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:507942/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:63199/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:679255/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:759482/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:788176/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:820172/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:839714/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:906239/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1041157/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1896095/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1810728/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1774194/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1747722/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1668811/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1628776/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1568795/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1515067/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1421586/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1388760/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1381581/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1324418/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1229003/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1045527/63‑1 (MQ=255) tGACATGGTTGGCAAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAc  <  1:1673547/63‑1 (MQ=255) |                                                               TGACATGGTTGGCGAGAAGGTACGTAGTAAGCCTCGTTATCGTTGCCAGAAATGTGGTTTTAC  >  W3110S.gb/1343297‑1343359

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑