Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1432532	1432563	32	12 [0]	[1] 21	stfR	predicted tail fiber protein

ATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACT  >  W3110S.gb/1432533‑1432614                                |                                                   aTGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACa                    >  1:2385631/1‑64 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCCTGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1042796/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1656457/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:268060/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:2476863/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:2158108/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:205144/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1884803/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1864293/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1835051/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1790417/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1740405/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1582897/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1572124/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1536132/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1321702/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1298629/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1247934/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1188161/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1164079/51‑1 (MQ=255)                                aTGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACt  <  1:1068580/51‑1 (MQ=255)                                |                                                   ATGCCTGGTGGCTGGACTGACAGGGGGCGTTATGCTTATGGCATGTTCTGGCAATATCAAAACAATGAACGAGCCATTCACT  >  W3110S.gb/1432533‑1432614

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑