Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1462885	1462930	46	18 [3]	[0] 26	paaJ	predicted beta‑ketoadipyl CoA thiolase

GGCGATTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGC  >  W3110S.gb/1462931‑1462995 |                                                                 ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:1968670/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:829190/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:755430/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:72430/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:643657/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:616700/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:60499/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:370858/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:2341952/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:2249099/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:220633/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:2194121/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:2073585/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:1018455/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:188596/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:1857890/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:1787561/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:1784040/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:1681068/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:1603112/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:156382/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:1461393/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:1454863/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:1262993/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:1250349/65‑1 (MQ=255) ggcgatTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGGCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGc  <  1:1447737/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GGCGATTTGCTGATCGCCGGTGGCGTGGAGTCAATGTCACGGGCACCGTTTGTTATGGGCAAGGC  >  W3110S.gb/1462931‑1462995

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑