Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1489439	1489467	29	25 [2]	[0] 22	ydcF	conserved hypothetical protein

CCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTT  >  W3110S.gb/1489468‑1489532 |                                                                 ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:2267538/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:937743/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:926634/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:801279/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:78382/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:766348/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:704815/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:602507/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:595736/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:447515/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:2413447/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:1026831/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:2247759/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:2087250/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:2026847/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:1944935/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:1816216/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:1481583/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:1405051/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:1105740/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:105626/65‑1 (MQ=255) ccacGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCtt  <  1:1035854/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CCACGCTGGTTAAGTTATCCCGGATTCGTTCCTCAGTTAGGAAATAACGCAGACAGTGTAATCTT  >  W3110S.gb/1489468‑1489532

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑