Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1582345	1582353	9	12 [0]	[0] 34	ydeM	conserved hypothetical protein

CAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATG  >  W3110S.gb/1582354‑1582417 |                                                                cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCTTg  <  1:770052/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:596195/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:2369499/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:238602/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:2441559/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:310/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:36532/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:403219/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:554450/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:569382/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:2221169/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:775009/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:77718/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:810372/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:882830/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:902615/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:942800/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:2008778/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:1280414/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:1282680/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:1305307/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:1319429/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:1409991/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:1447246/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:1578616/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:1634999/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:1226369/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:2058865/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:2059447/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:2076319/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:2085072/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:2112852/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:2203996/64‑1 (MQ=255) cAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATg  <  1:2207578/64‑1 (MQ=255) |                                                                CAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATG  >  W3110S.gb/1582354‑1582417

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑