Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1637152	1637185	34	21 [0]	[0] 27	stfQ	predicted side tail fibre assembly protein

CTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGA  >  W3110S.gb/1637186‑1637250 |                                                                 cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:2100246/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:971822/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:855867/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:792347/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:725314/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:360759/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:325229/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:314541/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:300087/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:2374458/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:2294603/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:2178372/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:2137578/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:2128219/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:1094722/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:20838/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:1914571/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:1858921/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:1756422/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:1464766/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:1404445/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:1399901/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:1301824/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:127059/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:1223226/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:111140/65‑1 (MQ=40) cTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCACTGCATCAGGGCATAACCAGACGGa  <  1:2067437/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CTGCAAGTTTCGGGTATGCAGATTTGTCAAAAGTCTGCCCCTGCATCAGGGCATAACCAGACGGA  >  W3110S.gb/1637186‑1637250

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑