Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1722449	1722499	51	19 [0]	[0] 63	slyA	DNA‑binding transcriptional activator

CACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTGCT  >  W3110S.gb/1722500‑1722564 |                                                                 cACCAACCGTGCCAGATCAGATCCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1476376/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGTTTCCAAttt                         >  1:1488434/1‑42 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTc                               >  1:2008533/1‑36 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAg        >  1:2336077/1‑59 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCtt     >  1:331096/1‑62 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCtt     >  1:92913/1‑62 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCtt     >  1:2162178/1‑62 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCtt     >  1:789505/1‑62 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCtt     >  1:1422811/1‑62 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCtt     >  1:726148/1‑62 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCtt     >  1:2407074/1‑62 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCtt     >  1:57843/1‑62 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCtt     >  1:517237/1‑62 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCtt     >  1:479775/1‑62 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCtt     >  1:345711/1‑62 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCt      >  1:953786/1‑61 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:2403018/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:2351732/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:2347714/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:2201511/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:2269679/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:2408971/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:2440097/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:2501436/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:260608/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:337949/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:345239/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:373169/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:376390/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:687793/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:826349/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:932918/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:952970/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:136691/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1430174/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1442489/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1471303/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1514359/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:154840/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1701134/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1770439/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1838224/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:184817/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1876861/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1884179/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1932139/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1933918/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1318230/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1953122/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:2052184/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:2090707/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:2126031/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:2138003/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1211341/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:2248180/1‑63 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTGCt  <  1:1080589/65‑1 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTGCt  <  1:1399810/65‑1 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTGCt  <  1:303891/65‑1 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTGCt  <  1:241572/65‑1 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTGCt  <  1:1070485/65‑1 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTGCt  <  1:2325320/65‑1 (MQ=255) cACCAACCGTGCCAGATCAGAAACTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTg    >  1:1651577/1‑63 (MQ=255) cACCAACAGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCtt     >  1:1155767/1‑62 (MQ=255) |                                                                 CACCAACCGTGCCAGATCAGAACCTAGTGGCGATTCCAATTTCATCTCCTTATAATTAGCTTGCT  >  W3110S.gb/1722500‑1722564

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑