Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1827077	1827119	43	10 [0]	[0] 29	spy	envelope stress induced periplasmic protein

CACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTG  >  W3110S.gb/1827120‑1827184 |                                                                 cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTgcgc                        >  1:460682/1‑43 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCttt   >  1:1222350/1‑64 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCttt   >  1:2356672/1‑64 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCttt   >  1:2321337/1‑64 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCttt   >  1:2128481/1‑64 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:988750/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:1205819/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:881602/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:845751/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:802966/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:566918/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:462197/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:405298/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:2274325/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:2228688/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:218703/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:2067925/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:2055575/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:1792141/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:1619287/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:1535759/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:1473592/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:146310/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:1367782/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:1343646/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:1283104/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:1269045/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTg  >  1:1219055/1‑65 (MQ=255) cACGCTGGCCTTTCATGATTTAGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGtcaggt             >  1:935683/1‑54 (MQ=255) |                                                                 CACGCTGGCCTTTCATGATTTCGCGGATCTGCTGTTTCTGCGCGTCGGTCAGGTTCAGGTCTTTG  >  W3110S.gb/1827120‑1827184

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑