Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1959333	1959348	16	11 [1]	[0] 32	torY	TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit

TTTATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAT  >  W3110S.gb/1959349‑1959412 |                                                                tttATGACAATCTATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:2033857/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1939634/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:952453/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:847192/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:84274/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:560727/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:493690/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:37347/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:2350685/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:2300781/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:2278714/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:2270674/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:2196005/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:2054953/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:2042238/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1955231/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1021792/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1804722/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1790516/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1696210/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1691583/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1585263/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1443357/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1403609/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1378964/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1352268/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1312416/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:124796/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1228598/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1169273/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1109483/64‑1 (MQ=255) tttATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAt  <  1:1025823/64‑1 (MQ=255) |                                                                TTTATGACAATCGATACAGGTTTCGCTGTCCTTTTGTGCTTTGTTATGCATTTTCTGCGCAGAT  >  W3110S.gb/1959349‑1959412

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑