Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1964239	1964315	77	20 [0]	[0] 17	[flhE]	[flhE]

TCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATC  >  W3110S.gb/1964316‑1964379 |                                                                tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTACCCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:2488757/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:2065801/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:90371/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:855418/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:526258/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:48121/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:349926/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:263721/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:2414547/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:1145792/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:1929480/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:19025/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:1746033/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:1479484/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:1306330/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:1220409/1‑64 (MQ=255) tCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATc  >  1:1180643/1‑64 (MQ=255) |                                                                TCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATC  >  W3110S.gb/1964316‑1964379

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑