Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	1965373	1965385	13	20 [0]	[0] 25	flhA	predicted flagellar export pore protein

CCAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATC  >  W3110S.gb/1965386‑1965448 |                                                               ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:2035217/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:788607/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:545235/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:511442/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:434222/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:38791/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:303670/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:2432283/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:2347195/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:2327943/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:2312204/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:2311134/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:2207702/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:1022817/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:1867464/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:1754618/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:1628731/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:1609011/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:125784/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:1211846/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:1192360/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:1149539/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:1094912/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATc  >  1:1074099/1‑63 (MQ=255) ccAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAAGGTTAATc  >  1:1870206/1‑63 (MQ=255) |                                                               CCAAATGCCGGATCGACGGTCGCCTCACCAGGTAACGTCCCGGCAGCGGTTCCAGGGTTAATC  >  W3110S.gb/1965386‑1965448

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑