Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2005533	2005560	28	14 [0]	[1] 8	fliC	flagellar filament structural protein

TCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCTTCGCGC  >  W3110S.gb/2005560‑2005625  |                                                                 tCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTG‑AACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCTTCgcgc  <  1:532818/65‑1 (MQ=255)  cAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCTTCgcgc  <  1:1259652/65‑1 (MQ=255)  cAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCTTCgcgc  <  1:1279535/65‑1 (MQ=255)  cAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCTTCgcgc  <  1:1777701/65‑1 (MQ=255)  cAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCTTCgcgc  <  1:188315/65‑1 (MQ=255)  cAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCTTCgcgc  <  1:2151067/65‑1 (MQ=255)  cAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCTTCgcgc  <  1:2313950/65‑1 (MQ=255)  cAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCTTCgcgc  <  1:2333199/65‑1 (MQ=255)  |                                                                 TCAGGCCTTTAATGTTAGAGGTGAAACGGTTAGCAATCGCCTGACCCGCTGCGTCATCCTTCGCGC  >  W3110S.gb/2005560‑2005625

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑