Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2006911	2007003	93	11 [0]	[0] 10	fliD	flagellar filament capping protein

CGTCAGTTCTTCCAGCTATAAAACGTTGGCGCAGATTGGTATCACGACCGATCCCAGCGATGGCA  >  W3110S.gb/2007004‑2007068 |                                                                 cGTCAGTTCTTCCAGCTATAAAACGTTGGCGCAGATTGGTATCACGCCCGATCCCAGCGATGGCa  >  1:911310/1‑65 (MQ=255) cGTCAGTTCTTCCAGCTATAAAACGTTGGCGCAGATTGGTATCACGACCGATCCCAGCGATGGCa  >  1:1115870/1‑65 (MQ=255) cGTCAGTTCTTCCAGCTATAAAACGTTGGCGCAGATTGGTATCACGACCGATCCCAGCGATGGCa  >  1:1162963/1‑65 (MQ=255) cGTCAGTTCTTCCAGCTATAAAACGTTGGCGCAGATTGGTATCACGACCGATCCCAGCGATGGCa  >  1:1218999/1‑65 (MQ=255) cGTCAGTTCTTCCAGCTATAAAACGTTGGCGCAGATTGGTATCACGACCGATCCCAGCGATGGCa  >  1:1233951/1‑65 (MQ=255) cGTCAGTTCTTCCAGCTATAAAACGTTGGCGCAGATTGGTATCACGACCGATCCCAGCGATGGCa  >  1:1281970/1‑65 (MQ=255) cGTCAGTTCTTCCAGCTATAAAACGTTGGCGCAGATTGGTATCACGACCGATCCCAGCGATGGCa  >  1:206840/1‑65 (MQ=255) cGTCAGTTCTTCCAGCTATAAAACGTTGGCGCAGATTGGTATCACGACCGATCCCAGCGATGGCa  >  1:2087989/1‑65 (MQ=255) cGTCAGTTCTTCCAGCTATAAAACGTTGGCGCAGATTGGTATCACGACCGATCCCAGCGATGGCa  >  1:2120489/1‑65 (MQ=255) cGTCAGTTCTTCCAGCTATAAAACGTTGGCGCAGATTGGTATCACGACCGATCCCAGCGATGGCa  >  1:2343558/1‑65 (MQ=255) |                                                                 CGTCAGTTCTTCCAGCTATAAAACGTTGGCGCAGATTGGTATCACGACCGATCCCAGCGATGGCA  >  W3110S.gb/2007004‑2007068

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑