Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2021079	2021290	212	4 [0]	[0] 22	fliK	flagellar hook‑length control protein

CAAAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGGA  >  W3110S.gb/2021291‑2021355 |                                                                 caaAGTGCAGTGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:696889/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:1083410/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:661897/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:562010/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:45556/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:394129/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:361864/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:318042/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:2501249/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:2456094/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:2270925/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:2258551/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:214819/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:2106843/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:2030867/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:2013093/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:1951086/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:1624213/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:1613767/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:1341743/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:1067407/65‑1 (MQ=255) caaAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGAAAATCTCCCTCAAAGTGga  <  1:852115/65‑1 (MQ=255) |                                                                 CAAAGTGCAGAGTTGCGTCTGCACCCGCAGGATTTAGGTGAAGTGCAAATCTCCCTCAAAGTGGA  >  W3110S.gb/2021291‑2021355

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑