Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2074325	2074362	38	4 [0]	[0] 7	flu	antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter

GCAAATACCACTGTGGTTTATGCCGGCGGCGACCAGACTGTACATGGTCACGCACTGGATACCAC  >  W3110S.gb/2074363‑2074427 |                                                                 gCAAATACCACTGTGGTTTATGCTGGCGGCGACCAGACTGTACATGGTCACGCACTGGATACCAc  <  1:619477/65‑1 (MQ=255) gCAAATACCACTGTGGTTTATGCCGGCGGCGACCAGACTGTACATGGTCACGCACTGGATACCAc  <  1:1411654/65‑1 (MQ=255) gCAAATACCACTGTGGTTTATGCCGGCGGCGACCAGACTGTACATGGTCACGCACTGGATACCAc  <  1:1892739/65‑1 (MQ=255) gCAAATACCACTGTGGTTTATGCCGGCGGCGACCAGACTGTACATGGTCACGCACTGGATACCAc  <  1:2079186/65‑1 (MQ=255) gCAAATACCACTGTGGTTTATGCCGGCGGCGACCAGACTGTACATGGTCACGCACTGGATACCAc  <  1:2105598/65‑1 (MQ=255) gCAAATACCACTGTGGTTTATGCCGGCGGCGACCAGACTGTACATGGTCACGCACTGGATACCAc  <  1:2196016/65‑1 (MQ=255) gCAAATACCACTGTGGTTTATGCCGGCGGCGACCAGACTGTACATGGTCACGCACTGGATACCAc  <  1:486818/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GCAAATACCACTGTGGTTTATGCCGGCGGCGACCAGACTGTACATGGTCACGCACTGGATACCAC  >  W3110S.gb/2074363‑2074427

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑