Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,976,020	C→T	L256F (CTC→TTC)	galR →	DNA‑binding transcriptional repressor

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,976,020	0	C	T	100.0%	183.1 / NA	53	L256F (CTC→TTC)	galR	DNA‑binding transcriptional repressor
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (25/28);  total (25/28)

CGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCTTTGAT  >  W3110S.gb/2975989‑2976073                                |                                                      cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:172657/1‑65 (MQ=255) cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:2270783/1‑65 (MQ=255) cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:2213611/1‑65 (MQ=255) cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:2206542/1‑65 (MQ=255) cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:2148913/1‑65 (MQ=255) cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:2129695/1‑65 (MQ=255) cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:179053/1‑65 (MQ=255) cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:343408/1‑65 (MQ=255) cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:956671/1‑65 (MQ=255) cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:952949/1‑65 (MQ=255) cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:899311/1‑65 (MQ=255) cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:1123022/1‑65 (MQ=255) cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:1232287/1‑65 (MQ=255) cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:1276969/1‑65 (MQ=255) cGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTTGCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTgaga                      >  1:2303894/1‑65 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:2473413/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:1061015/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:2338404/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:2356637/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:2402521/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:896811/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:2537561/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:973960/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:400232/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:547008/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:638438/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:686738/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:718194/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:1308437/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:1078040/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:1384894/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:1090569/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:1110133/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:1865605/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:1221626/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:1744070/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:1535651/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:1506727/65‑1 (MQ=255)                 ggTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:2228731/65‑1 (MQ=255)                  gTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:868399/64‑1 (MQ=255)                  gTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:628035/64‑1 (MQ=255)                  gTGCGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:2049138/64‑1 (MQ=255)                     cGATGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCtt      <  1:531586/61‑1 (MQ=255)                        tGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCTTtgat  >  1:5484/1‑62 (MQ=255)                        tGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCTTtgat  >  1:839069/1‑62 (MQ=255)                        tGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCTTtgat  >  1:1071608/1‑62 (MQ=255)                        tGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCTTtgat  >  1:1279984/1‑62 (MQ=255)                        tGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCTTtgat  >  1:704193/1‑62 (MQ=255)                        tGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCTTtgat  >  1:1764251/1‑62 (MQ=255)                        tGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCTTtgat  >  1:1993655/1‑62 (MQ=255)                        tGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCTTtgat  >  1:2027997/1‑62 (MQ=255)                        tGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCTTtgat  >  1:2138269/1‑62 (MQ=255)                        tGGGCGTTTTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCTTtgat  >  1:2283520/1‑62 (MQ=255)                                |                                                      CGATTCAATGGCGGCGGGTGCGATGGGCGTTCTCAATGATAATGGTATTGATGTACCGGGTGAGATTTCGTTAATTGGCTTTGAT  >  W3110S.gb/2975989‑2976073

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑