Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,234,681	T→A	I22I (ATT→ATA)	ygjP →	predicted metal dependent hydrolase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,234,681	0	T	A	100.0%	158.4 / NA	48	I22I (ATT→ATA)	ygjP	predicted metal dependent hydrolase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base A (48/0);  total (48/0)

ACTTTCCCAGGTGCGAACACTGATTAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATC  >  W3110S.gb/3234657‑3234721                         |                                         acattCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGAGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:200663/4‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCaa           >  1:2040434/1‑56 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTAt   >  1:1078823/1‑64 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTAt   >  1:1403399/1‑64 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:3706/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:91343/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:2073353/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1066645/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:2117183/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:2121657/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:2145909/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:2165517/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:2285681/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:2505140/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:2542599/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:813717/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:390873/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:44423/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:525258/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:836382/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:571912/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:690459/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:750933/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:784726/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:792064/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:794923/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1474644/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1141213/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1191804/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1226939/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1238717/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:131453/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1344498/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1348140/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1364819/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1370122/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1431023/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:2057082/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1486944/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1542815/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1557203/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1584124/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1684568/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1692642/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1821193/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1978130/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATc  >  1:2023872/1‑65 (MQ=255) aCTTTCCCAGGTGCGAACGCTGATAAACGAACAGCCTCTGGGCGATGTCCTGGCAAAACGCTATc  >  1:1870776/1‑65 (MQ=255)                         |                                         ACTTTCCCAGGTGCGAACACTGATTAACGAACAGCGTCTGGGCGATGTGCTGGCAAAACGCTATC  >  W3110S.gb/3234657‑3234721

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑