Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	4,042,971	G→A	A39T (GCC→ACC)	livK →	leucine transporter subunit

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	4,042,971	0	G	A	100.0%	159.8 / NA	45	A39T (GCC→ACC)	livK	leucine transporter subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (0/45);  total (0/45)

CGTTGTCGGCGCGATGTCCGGCCCGATTGCCCAGTGGGGCGATATGGAATTTAACGGCGCGCGTCAGGCAATTAAAGACATTAA  >  W3110S.gb/4042943‑4043026                             |                                                        cGTTGTCGTCGCGATGTCCGGCCCGATTACCCAGTGTGGCGATATGGAATTTAACGGCGCGCGTc                     <  1:1018621/65‑1 (MQ=255) cGTTGTCGGCGCGATGTCCGGCCCGATTACCCAGTGGGGCGATATGGAATTTAACGGcgcgcggc                     <  1:724192/65‑3 (MQ=255) cGTTGTCGGCGCGATGTCCGGCCCGATTACCCAGTGGGGCGATATGGAATTTAACGGCGCGCGTc                     <  1:309084/65‑1 (MQ=255) cGTTGTCGGCGCGATGTCCGGCCCGATTACCCAGTGGGGCGATATGGAATTTAACGGCGCGCGTc                     <  1:307116/65‑1 (MQ=255) cGTTGTCGGCGCGATGTCCGGCCCGATTACCCAGTGGGGCGATATGGAATTTAACGGCGCGCGTc                     <  1:2525133/65‑1 (MQ=255) cGTTGTCGGCGCGATGTCCGGCCCGATTACCCAGTGGGGCGATATGGAATTTAACGGCGCGCGTc                     <  1:350162/65‑1 (MQ=255) cGTTGTCGGCGCGATGTCCGGCCCGATTACCCAGTGGGGCGATATGGAATTTAACGGCGCGCGTc                     <  1:2312000/65‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑