Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,006,848	A→T	K159* (AAA→TAA)	ycbW →	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,006,848	0	A	T	100.0%	85.4 / NA	27	K159* (AAA→TAA)	ycbW	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (0/27);  total (0/27)

GGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAA  >  W3110S.gb/1006818‑1006882                               |                                   ggTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:867139/65‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:118602/65‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:569642/65‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:1245959/65‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:1726300/65‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:203322/65‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:2178643/65‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:2218868/65‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:2249686/65‑1 (MQ=255)  gTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:1389618/64‑1 (MQ=255)    cgcgcgATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:1140069/62‑1 (MQ=255)    cgcgcgATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:857894/62‑1 (MQ=255)    cgcgcgATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:562815/62‑1 (MQ=255)    cgcgcgATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:472093/62‑1 (MQ=255)    cgcgcgATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:415184/62‑1 (MQ=255)    cgcgcgATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:226583/62‑1 (MQ=255)    cgcgcgATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:2255708/62‑1 (MQ=255)    cgcgcgATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:192702/62‑1 (MQ=255)    cgcgcgATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:1694391/62‑1 (MQ=255)    cgcgcgATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:1229711/62‑1 (MQ=255)    cgcgcgATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:1222087/62‑1 (MQ=255)    cgcgcgATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:1169872/62‑1 (MQ=255)    cgcgcgATGCAGTTGGGCGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:1036685/62‑1 (MQ=255)    cgcgcgATGCAGTTGGGCGACGCCAATTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:878313/62‑1 (MQ=255)                    gCGACGCCATTTAAATCTTGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:408738/46‑1 (MQ=38)                     cGACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:2427626/45‑1 (MQ=255)                      gACGCCATTTAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa  <  1:2476821/44‑1 (MQ=255)                               |                                   GGTCGCGCGATGCAGTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAA  >  W3110S.gb/1006818‑1006882

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑