Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,225,448	G→A	P59P (CCG→CCA)	ycgI →	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,225,448	0	G	A	100.0%	43.3 / NA	14	P59P (CCG→CCA)	ycgI	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (2/12);  total (2/12)

CATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCGTGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCATCA  >  W3110S.gb/1225425‑1225490                        |                                           cATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCATGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCAt    <  1:1271268/64‑1 (MQ=255) cATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCATGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCAt    <  1:1972245/64‑1 (MQ=255) cATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCATGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCAt    <  1:2252022/64‑1 (MQ=255) cATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCATGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCAt    <  1:2322295/64‑1 (MQ=255) cATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCATGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCAt    <  1:310915/64‑1 (MQ=255) cATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCATGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCAt    <  1:365799/64‑1 (MQ=255) cATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCATGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCAt    <  1:511028/64‑1 (MQ=255) cATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCATGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCAt    <  1:56686/64‑1 (MQ=255) cATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCATGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCAt    <  1:589304/64‑1 (MQ=255) cATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCATGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCAt    <  1:799633/64‑1 (MQ=255) cATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCATGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCAt    <  1:95186/64‑1 (MQ=255) cATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCATGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACAAt    <  1:1640192/64‑1 (MQ=255)   tGGTGCCGGTGTGGAATCCCCATGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCATCa  >  1:107133/1‑64 (MQ=255)   tGGTGCCGGTGTGGAATCCCAATGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGCCCATCa  >  1:819024/1‑64 (MQ=14)                        |                                           CATGGTGCCGGTGTGGAATCCCCGTGGAACGCGGTGGCTGGTGTGAACTGGTCGTTCTGACCATCA  >  W3110S.gb/1225425‑1225490

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑