Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,265,644 C→T L118L (CTC→CTT hemA → glutamyl tRNA reductase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,265,6440CT100.0% 164.4 / NA 48L118L (CTC→CTThemAglutamyl tRNA reductase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (19/29);  total (19/29)

GCCAGCGGCCTGGATTCACTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTCGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAGGTCATA  >  W3110S.gb/1265600‑1265687
                                            |                                           
gCCAGCGGCCTGGATTCTCTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGtt                         >  1:1991603/1‑65 (MQ=255)
gCCAGCGGCCTGGATTCACTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGtt                         >  1:939736/1‑65 (MQ=255)
gCCAGCGGCCTGGATTCACTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGtt                         >  1:283212/1‑65 (MQ=255)
gCCAGCGGCCTGGATTCACTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGtt                         >  1:1494908/1‑65 (MQ=255)
gCCAGCGGCCTGGATTCACTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGtt                         >  1:1183982/1‑65 (MQ=255)
gCCAGCGGCCTGGATTCACTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGt                          >  1:870418/1‑64 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:79748/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:72578/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:70418/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:49349/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:347126/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:271445/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:265176/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:2484667/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:2458219/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:2258338/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:2074167/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:2091553/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:198746/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:1183052/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:1478490/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:1482060/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:1972541/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:1707062/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:1712035/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:1842122/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:1416844/64‑1 (MQ=255)
                  cTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:1394218/64‑1 (MQ=255)
                   tGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:1770561/63‑1 (MQ=255)
                   tGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:1061573/63‑1 (MQ=255)
                   tGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:515222/63‑1 (MQ=255)
                   tGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:1642091/63‑1 (MQ=255)
                        cTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCGAAAAGGTCata  >  1:1461449/1‑64 (MQ=255)
                        cTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAGGTCata  >  1:61081/1‑64 (MQ=255)
                        cTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAGGTCata  >  1:533534/1‑64 (MQ=255)
                        cTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAGGTCata  >  1:742842/1‑64 (MQ=255)
                        cTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAGGTCata  >  1:1275219/1‑64 (MQ=255)
                        cTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAGGTCata  >  1:269179/1‑64 (MQ=255)
                        cTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAGGTCata  >  1:1659370/1‑64 (MQ=255)
                        cTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAGGTCata  >  1:2391433/1‑64 (MQ=255)
                        cTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAGGTCata  >  1:2309229/1‑64 (MQ=255)
                        cTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAGGTCata  >  1:2222314/1‑64 (MQ=255)
                        cTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAGGTCata  >  1:2174072/1‑64 (MQ=255)
                        cTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAGGTCata  >  1:1853418/1‑64 (MQ=255)
                        cTGGGGGAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAGGTCata  >  1:1862830/1‑64 (MQ=255)
                             ggAGCCGCAGATCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:2038199/53‑1 (MQ=255)
                                       aTCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:984408/43‑1 (MQ=255)
                                       aTCCTTGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAg        <  1:2139066/43‑1 (MQ=255)
                                            |                                           
GCCAGCGGCCTGGATTCACTGGTTCTGGGGGAGCCGCAGATCCTCGGTCAGGTTAAAAAAGCGTTTGCCGATTCGCAAAAAGGTCATA  >  W3110S.gb/1265600‑1265687

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: