Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	1,287,420	G→T	Q235H (CAG→CAT)	narJ →	molybdenum‑cofactor‑assembly chaperone subunit (delta subunit) of nitrate reductase 1

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	1,287,420	0	G	T	100.0%	105.5 / NA	31	Q235H (CAG→CAT)	narJ	molybdenum‑cofactor‑assembly chaperone subunit (delta subunit) of nitrate reductase 1
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base T (31/0);  total (31/0)

CTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACAGCACTAATGCAATT  >  W3110S.gb/1287369‑1287433                                                    |              cTTTTCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:929154/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:2129951/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:903785/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:865453/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:750840/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:651486/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:643853/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:496634/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:466011/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:346417/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:2492483/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:2485415/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:2482515/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:2304901/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:2242569/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:2234979/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:1034229/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:2049417/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:200911/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:1785456/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:1746064/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:1711543/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:1708781/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:165814/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:1569191/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:1536087/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:1393230/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:1343939/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:1111019/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAtt  >  1:1075030/1‑65 (MQ=255) cTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACATCACTAATGCAAt   >  1:1266922/1‑64 (MQ=255)                                                    |              CTTTGCCGGTGCCGTCGCGCCGCAATATCTGAATATCACCACCGGAGGACAGCACTAATGCAATT  >  W3110S.gb/1287369‑1287433

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑